總體來看，我國(guó)物流中心存在著經(jīng)營(yíng)分散，社會(huì)化程度低，物流布局不合理，物流技術(shù)含量低等問題。
1)體制弊端
目前在我國(guó)經(jīng)濟(jì)領(lǐng)域中存在的部門分割、地區(qū)分割等現(xiàn)象，嚴(yán)重阻礙了現(xiàn)代化物流中心的發(fā)展。由于各部門、各地區(qū)都從自身的利益出發(fā)，存在一種“肥水不流外人田”的思想，在制定發(fā)展規(guī)劃時(shí)，缺乏必要的統(tǒng)籌與協(xié)調(diào)，缺乏綜合性規(guī)劃。較為常見的是鐵路與公路等運(yùn)輸部門都組建了自已的物流中心，但這些物流中心橫向聯(lián)系少，資源不能共享，造成重復(fù)建設(shè)5資源的利用率低。
專業(yè)化分工和協(xié)作是物流中心賴以生存和發(fā)展的基礎(chǔ)環(huán)境，條塊分割和區(qū)域封鎖卻嚴(yán)重制約著現(xiàn)代化物流中心的建設(shè)和發(fā)展。主要表現(xiàn)在產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)趨同化，即各地區(qū)沒有很好地根據(jù)當(dāng)?shù)氐膶?shí)際情況，建立起能發(fā)揮本地區(qū)優(yōu)勢(shì)的產(chǎn)業(yè)，做到與其他地區(qū)優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)。這種不合理性降低了地區(qū)間的比較優(yōu)勢(shì)，減少了商品流通的相對(duì)規(guī)模，使物流中心的生存空間受到相當(dāng)擠壓，增加了物流中心開展業(yè)務(wù)的難度，削弱了物流中心可能帶來的比較利益。
2)物流中心信息化程度較低
目前，我國(guó)的物流中心在獲取信息的手段和技術(shù)等方面與國(guó)外物流中心相比，有很大的差距。盡管我國(guó)的物流中心也已經(jīng)開始了物流中心網(wǎng)絡(luò)化建設(shè)，但其網(wǎng)絡(luò)的覆蓋面還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足需求。在信息化時(shí)代，沒有及時(shí)、準(zhǔn)確、全面的信息支持，物流中心的成功運(yùn)作是相當(dāng)困難的。
3)物流中心的社會(huì)化程度較低
目前我國(guó)的生產(chǎn)企業(yè)、流通企業(yè)中的“大而全”、“小而全”現(xiàn)象和思想仍然存在，這些企業(yè)一般都擁有自己的物流體系，這就造成了我國(guó)物流中心的規(guī)模小而分散，社會(huì)化、組織化程度低，在物流配送的各環(huán)節(jié)上銜接配套差，物流服務(wù)功能不完善。
4)物流中心的信譽(yù)有待提高
目前我國(guó)的物流中心還遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒有實(shí)現(xiàn)規(guī)模經(jīng)營(yíng)，因此帶來的信譽(yù)問題是不可避免的。物流中心不能按照事先與客戶達(dá)成的協(xié)議，圓滿完成物流服務(wù)，從而使自己在客戶中的聲譽(yù)受到影響，這種現(xiàn)象經(jīng)常出現(xiàn)。這將對(duì)該物流中心未來的發(fā)展帶來嚴(yán)重影響。